Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNTG1Q9NSN8 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms