Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC52A2Q9HAB3 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms