Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms