Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F2

TMEM38A, Trimeric intracellular cation channel type A, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM38AQ9H6F2 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM38AQ9H6F2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM38AQ9H6F2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms