Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ROPN1BQ9BZX4 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ROPN1BQ9BZX4 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms