Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HDAC8Q9BY41 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms