Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RBBP8Q99708 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBBP8Q99708 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms