Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP88Q99567 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms