Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF2

STAC3, SH3 and cysteine-rich domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAC3Q96MF2 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STAC3Q96MF2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STAC3Q96MF2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STAC3Q96MF2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STAC3Q96MF2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STAC3Q96MF2 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STAC3Q96MF2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STAC3Q96MF2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STAC3Q96MF2 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STAC3Q96MF2 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STAC3Q96MF2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STAC3Q96MF2 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STAC3Q96MF2 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
STAC3Q96MF2 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STAC3Q96MF2 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STAC3Q96MF2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STAC3Q96MF2 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STAC3Q96MF2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STAC3Q96MF2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STAC3Q96MF2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STAC3Q96MF2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
STAC3Q96MF2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STAC3Q96MF2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STAC3Q96MF2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STAC3Q96MF2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STAC3Q96MF2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STAC3Q96MF2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STAC3Q96MF2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STAC3Q96MF2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STAC3Q96MF2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STAC3Q96MF2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STAC3Q96MF2 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STAC3Q96MF2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STAC3Q96MF2 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STAC3Q96MF2 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STAC3Q96MF2 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STAC3Q96MF2 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STAC3Q96MF2 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STAC3Q96MF2 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STAC3Q96MF2 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STAC3Q96MF2 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STAC3Q96MF2 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms