Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDK5RAP3Q96JB5 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDK5RAP3Q96JB5 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDK5RAP3Q96JB5 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDK5RAP3Q96JB5 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDK5RAP3Q96JB5 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDK5RAP3Q96JB5 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDK5RAP3Q96JB5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDK5RAP3Q96JB5 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDK5RAP3Q96JB5 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDK5RAP3Q96JB5 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDK5RAP3Q96JB5 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDK5RAP3Q96JB5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CDK5RAP3Q96JB5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDK5RAP3Q96JB5 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDK5RAP3Q96JB5 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDK5RAP3Q96JB5 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms