Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms