Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPTSSAQ969W0 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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