Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms