Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ19

KCTD13, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD13Q8WZ19 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KCTD13Q8WZ19 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms