Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms