Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMIEQ8NEW7 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms