Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC112Q8NEF3 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms