Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PIK3C3Q8NEB9 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PIK3C3Q8NEB9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms