Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLIP4Q8N3C7 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CLIP4Q8N3C7 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
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