Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBP4Q8N2S1 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms