Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HAPLN4Q86UW8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HAPLN4Q86UW8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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