Protein–RNA interactions for Protein: Q7LBR1

CHMP1B, Charged multivesicular body protein 1b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1BQ7LBR1 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1BQ7LBR1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms