Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HACD2Q6Y1H2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD2Q6Y1H2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD2Q6Y1H2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD2Q6Y1H2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD2Q6Y1H2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD2Q6Y1H2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD2Q6Y1H2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD2Q6Y1H2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD2Q6Y1H2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD2Q6Y1H2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD2Q6Y1H2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD2Q6Y1H2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD2Q6Y1H2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD2Q6Y1H2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD2Q6Y1H2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD2Q6Y1H2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD2Q6Y1H2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD2Q6Y1H2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD2Q6Y1H2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD2Q6Y1H2 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD2Q6Y1H2 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD2Q6Y1H2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD2Q6Y1H2 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD2Q6Y1H2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD2Q6Y1H2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD2Q6Y1H2 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD2Q6Y1H2 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HACD2Q6Y1H2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms