Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms