Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
ZBED9Q6R2W3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED9Q6R2W3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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