Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CARMIL2Q6F5E8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CARMIL2Q6F5E8 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms