Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNS3Q68CZ2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TNS3Q68CZ2 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms