Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM4

PRAMEF8, PRAME family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF8Q5VWM4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEF8Q5VWM4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms