Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Q5VSD8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Q5VSD8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Q5VSD8 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms