Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C10orf55Q5SWW7 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms