Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRMS1LQ5PSV4 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms