Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDK2Q58EX2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms