Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HSD17B12Q53GQ0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HSD17B12Q53GQ0 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms