Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFTN2Q52LD8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms