Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC38Q502W7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms