Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TTLL9Q3SXZ7 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TTLL9Q3SXZ7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms