Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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ECM1Q16610 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECM1Q16610 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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