Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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GABRA6Q16445 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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GABRA6Q16445 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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GABRA6Q16445 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GABRA6Q16445 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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