Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
E2F4Q16254 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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E2F4Q16254 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F4Q16254 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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