Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USF2Q15853 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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