Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITSN1Q15811 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms