Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SKIV2LQ15477 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SKIV2LQ15477 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms