Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYTH1Q15438 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH1Q15438 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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