Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC23BQ15437 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms