Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
PTPRKQ15262 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRKQ15262 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
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