Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PDCD1Q15116 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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