Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NFIXQ14938 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
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