Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
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GBX1Q14549 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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GBX1Q14549 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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GBX1Q14549 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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GBX1Q14549 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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GBX1Q14549 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
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GBX1Q14549 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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GBX1Q14549 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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GBX1Q14549 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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GBX1Q14549 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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GBX1Q14549 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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GBX1Q14549 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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GBX1Q14549 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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GBX1Q14549 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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GBX1Q14549 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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GBX1Q14549 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBX1Q14549 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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