Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK13Q14004 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK13Q14004 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
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