Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL1Q13616 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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